Mikrobianalyysin perusperiaate on käyttää mikro-organismien ominaisuuksia ja toimintoja näytteissä olevien yhdisteiden kvalitatiiviseen ja kvantitatiiviseen analyysiin. Tarkemmin sanottuna testattavan näytteen yhdisteet muutetaan havaittavissa oleviksi tuotteiksi mikrobien biopelkistyksen, biohapetuksen ja muiden reaktioiden kautta, minkä jälkeen yhdisteiden pitoisuus näytteessä lasketaan mittaamalla tuotteiden määrä.
Mikrobianalyysin toimintamenettelyt sisältävät pääasiassa seuraavat vaiheet:
1. Näytteenotto: Kerää edustavia näytteitä analyysin tarkoituksen ja vaatimusten mukaisesti.
2. Näytteen esikäsittely: Esikäsittele kerätyt näytteet, mukaan lukien murskaus, homogenointi ja muut vaiheet, jotta näytteen yhdisteet vapautuvat kokonaan.
3. Mikrobisiirrostus ja viljely: Inokuloi esikäsitellyt näytteet tiettyyn mikrobiviljelyalustaan, säädä asianmukaisia lämpötila- ja kosteusolosuhteita ja anna mikro-organismien kasvaa ja lisääntyä.
4. Määritä tuotteiden määrä: Mikro-organismien kasvun ja lisääntymisen aikana muodostuu tietty määrä aineenvaihduntatuotteita. Näytteen yhdisteiden pitoisuus määritetään mittaamalla näiden tuotteiden määrä. Yleisiä määritysmenetelmiä ovat kolorimetria, fluoresenssi, massaspektrometria jne.
